舊世紀人類發生過很多次大戰，為了搶奪資源，為了野心慾望，大量的生命消逝。 突然消失的生命成為飛散的靈魂四處漂流，甚至帶著還在戰鬥的意志散落各處。 大和，據說是舊世紀相當有名的戰，曾經是一代強權的象徵。 在那一次的大戰中，隨著最後大和戰艦的沈沒，戰爭也漸漸走向尾聲，暫時結束了多年的大戰。

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如今，Yamato以另一種姿態在天空航行，巨大的人形頭骨中收納著過去散落四處的靈魂， 密佈的武裝形成強大的威嚇，並以阿修羅為中心，左右有風神雷神鎮守，不容輕易靠近。 那些尚有戰爭意識的魂魄必須得牢牢封印，不得再被任何有野心之人打開。 無數的靈魂聚集形成金黃色的光點，Yamato兜形空中戰艦乘載著這些意識與怨念，獨自航行。